Zasady przyjęcia studentów na realizację pracy magisterskiej w Zakładzie Mikrobiologii Farmaceutycznej WUM
Prace magisterskie w Zakładzie Mikrobiologii Farmaceutycznej mogą realizować zarówno studenci kierunku Analityka Medyczna, jak i Farmacja.
Pierwszeństwo w przyjęciu na realizację pracy mają członkowie Studenckiego Koła Naukowego przy ZMFiB oraz studenci zainteresowani mikrobiologią i tematyką badawczą prowadzoną w Jednostce. Student decydujący się na realizację pracy magisterskiej w ZMFiB wyraża zgodę na członkostwo w SKN działającym przy Zakładzie. Mile widziane są osoby, które wybrały w toku studiów na kierunku Farmacja blok fakultatywny „Farmacja Przemysłowa i Biotechnologia Farmaceutyczna”.
W ostatecznym zakwalifikowaniu studenta będzie brana po uwagę również ocena końcowa z przedmiotu Mikrobiologia/Diagnostyka Mikrobiologiczna uzyskana na III roku studiów oraz rozmowa z opiekunem/promotorem pracy.
Aktualne tematy prac magisterskich:
Promotorka: dr hab. Agnieszka Laudy
- Genotypowa analiza kolekcji izolatów klinicznych Acinetobacter baumannii.
Opis: W pracy będą wykonywane analizy występowania genów kodujących nabyte karbapenemazy CHDL metodą PCR oraz badanie podobieństwa izolatów metoda PFGE. Ponadto będą prowadzone testy mające na celu wytypowanie bezpiecznego barwnika, który umożliwi najefektywniejszą detekcję DNA w żelach agarozowych po rozdziale elektroforetycznym badanych próbek w obydwu w/w metodach.
Temat wymaga intensywnej pracy w okresie 25.08-30.09.2025.
- Selekcja bakteryjnych mutantów w obecności antyseptyków.
Opis: W pracy będą w pierwszym etapie określane dla wybranych szczepów bakterii Gram-dodatnich i Gram-ujemnych wartości MIC antyseptyków tj. chlorheksydyny i octenidyny. Następnie będą prowadzone badania możliwości selekcji jednostopniowych spontanicznych mutantów w obecności tych antyseptyków, badanie przez rozgłaskanie bakteryjnych zawiesin o dużej gęstości na płytki agarowe. Dla uzyskanych mutantów będą wykonywane analizy zmiany wrażliwości na antyseptyki i antybiotyki w stosunku do szczepu rodzicielskiego oraz porównanie uzyskanych danych do wyników wrażliwości mutantów wielostopniowych.
Temat wymaga intensywnej pracy w okresie 25.08-30.09.2025.
Promotorka: dr Renata Wolinowska
- Analiza bakteriofagów obecnych w mikrobiomie jelit i na błon śluzowych.
Opis: Aktywność mikrobioty jelit i innych organów ma ogromny wpływ na funkcjonowanie organizmu. Bakteriofagi kontrolują liczebność i namnażanie się poszczególnych gatunków bakterii. Niewiele wiadomo liczebności i zróżnicowaniu tych bakteriofagów. Przedmiotem analiz, prowadzonych metodami klasycznymi i molekularnymi, będzie analiza obecności bakteriofagów w mikrobiocie jelit i błon śluzowych jamy ustnej.
Promotorka: dr Anna Laskowska
- Poszukiwanie nowych związków aktywnych wobec Helicobacter pylori
Opis: Pierwszym etapem pracy będzie wypracowanie stabilnej metody hodowli H. pylori pozwalającej na otrzymywanie powtarzalnych wyników. W drugim etapie przebadana zostanie aktywność wybranych związków peptydowych lub pochodzenia naturalnego.
Promotorka: dr Anna Pietruczuk-Padzik
- Wpływ stężeń podprogowych (sub-MIC) na właściwości adhezyjne oraz zdolność tworzenia biofilmu przez szczepy wyizolowane z zakażeń dolnych dróg oddechowych.
Opis: Bakteryjne zakażenia dróg oddechowych stanowią duży problem terapeutyczny, zwłaszcza u pacjentów długotrwale hospitalizowanych oraz poddawanych sztucznej wentylacji. Zalegająca wydzielina w drogach oddechowych sprzyja rozwojowi bakterii oraz tworzeniu biofilmu. Przyjmuje się, że aby uzyskać efekt terapeutyczny, stężenie leku powinno być przez ponad połowę czasu pomiędzy dawkami, powyżej wartości minimalnego stężenia hamującego (MIC). Jednak podczas terapii antybiotykami często drobnoustroje poddawane są działaniu leku w stężeniu podprogowym, czyli niższym niż MIC. Dlatego w ramach prowadzonych badań zbadany zostanie wpływ działania stężeń podprogowych antybiotyków i chemioterapeutyków na zdolność szczepów do adhezji, wytwarzania substancji pozakomórkowej oraz tworzenia biofilmu w warunkach in vitro.
- Badanie działania przeciwdrobnoustrojowego wybranych leków i produktów leczniczych zawierających substancje pochodzenia roślinnego oraz synergizmu substancji pochodzenia roślinnego z antybiotykami w odniesieniu do szczepów wyizolowanych z zakażeń dróg oddechowych.
Opis: Leki roślinne od dawna wykorzystywane są w leczeniu zakażeń dróg oddechowych. Często leczenie to ma charakter terapii wspomagającej terapię antybiotykową. Celem badań będzie sprawdzenie działania przeciwdrobnoustrojowego leków i produktów leczniczych zawierających substancje pochodzenia roślinnego, powszechnie dostępnych w aptekach, na drobnoustroje wyizolowane z zakażeń dróg oddechowych. Zbadany zostanie również potencjalny synergizm substancji pochodzenia roślinnego z antybiotykami stosowanymi w leczeniu tego typu zakażeń bakteryjnych.
Promotorka: dr hab. Joanna Stefańska
- Charakterystyka szczepów ziarenkowców koagulazo-ujemnych izolowanych ze środowiska, w tym ekranów dotykowych różnych ogólnodostępnych urządzeń elektronicznych.
Promotor: prof. dr hab. Jakub Piwowarski
- Rola wewnątrzkomórkowych toksyn E. coli w nawracających zakażeniach układu moczowego.
Opiekun pracy: dr Marcin Równicki
Opis: Nawracające zakażenia układu moczowego są przykładem przewlekłej choroby bakteryjnej, której nieodłącznym elementem jest obecność komórek przetrwałych (ang. persister cells). Komórki te mają zdolność przetrwania antybiotykoterapii w stanie uśpienia, by następnie „obudzić się” i ponownie wywołać nawrót choroby. Podczas realizacji pracy magisterskiej będziesz mieć okazję zbadać, w jaki sposób komórki przetrwałe uropatogennej Escherichia coli wznawiają wzrost, analizując proces neutralizacji toksyn. W ramach badań przeanalizujemy m.in. rolę źródła węgla, poziom energii w komórkach przetrwałych oraz mechanizmy umożliwiające ich przetrwanie w mikrobiomie jelitowym.
- Wpływ ekstraktu z Geum urbanum na czynniki wirulencji wybranych patogenów jamy ustnej. (Farmacja)
Opiekunka pracy: dr inż. Aleksandra Kruk
Opis: Mikrobiota jamy ustnej tworzy dynamiczne, trójwymiarowe społeczności, w których złożone zależności mogą wpływać na funkcjonowanie całego organizmu. Szczególnie niebezpieczna jest dysbioza, mogąca prowadzić do przewagi bakterii patogennych zdolnych do skutecznej kolonizacji dzięki zaawansowanym mechanizmom wirulencji. Mechanizmami tymi są głównie: zdolność do tworzenia biofilmu, produkcja kwasu mlekowego, tolerancja na kwaśny odczyn środowiska czy synteza białek umożliwiających adhezję bakterii do komórek nabłonkowych. W proponowanej pracy zostanie przeanalizowany wpływ ekstraktu z Geum urbanum, tradycyjnie stosowanego w łagodzeniu dolegliwości jamy ustnej, na ograniczenie czynników wirulencji wybranych patogennych szczepów jamy ustnej należących do gatunków Streptococcus mutans lub/i Porphyromonas gingivalis.
- Ocena aktywności wybranych peptydów przeciwdrobnoustrojowych pochodzenia bakteryjnego wobec komórek nowotworowych.
Opiekunka pracy: dr Aleksandra Tymoszewska
Opis: Nowotwory stanowią jedną z najczęstszych przyczyn zgonów na świecie. Mimo, że podstawowymi metodami leczenia nowotworów są chemioterapia, radioterapia i chirurgia, ich poważne skutki uboczne oraz rosnący problem lekooporności sprawiają, że ciągle trwają poszukiwania nowych, skutecznych terapii przeciwnowotworowych. Peptydy przeciwdrobnoustrojowe (ang. Antimicrobial Peptides – AMP) to krótkie peptydy, które stanowią część wrodzonej odpowiedzi immunologicznej wielu organizmów. AMP produkowane przez bakterie posiadają dobrze udokumentowaną zdolność do zabijania lub hamowania wzrostu blisko spokrewnionych bakterii. Niemniej jednak, badania przeprowadzone w ostatnich latach wskazują, że niektóre z nich posiadają również aktywność przeciwnowotworową. Identyfikacja AMP o aktywności przeciwnowotworowej i dokładna charakterystyka mechanizmów ich działania, są kluczowe dla opracowania nowych terapii z wykorzystaniem tych związków. Dlatego celem przestawionej pracy będzie ocena działania wybranych AMP pochodzenia bakteryjnego wobec komórek nowotworowych.